2009年
Oshima, M., Kato, Y., Masuda, R., Kimura, S. and Yamashita, Y. (2009) Effect of turbulence on feeding intensity and survival of Japanese flounder Paralichthys olivaceus pelagic larvae. Journal of Fish Biology, 75, 1639-1647.
Miller, M.J., Kimura, S., Friedland, K.D., Knights, B., Kim, H.,Kim, Jellyman, D.J. and Tsukamoto, K. (2009) Potential effects of ocean-atmospheric changes on recruitment of temperate anguillid eels in the Atlantic and Pacific oceans, In “Challenges for Diadromous Fishes in a Dynamic Global Environment”. American Fisheries Society, 69, 231-249.
Zenimoto, K., Kitagawa, T., Miyazaki, S., Sasai, Y., Sasaki, H. and Kimura, S. (2009) The effects of seasonal and interannual variability of oceanic structure in the western Pacific North Equatorial Current on larval transport of the Japanese eel Anguilla japonica. Journal of Fish Biology, 74, 1878-1890.
Miyake, Y., Kimura, S., Kawamura, T., Horii, T., Kurogi, H. and Kitagawa, T. (2009) Simulating larval dispersal processes for abalone using a coupled particle-tracking and hydrodynamic model: implications for refugium design. Marine Ecology Progress Series, 387, 205-222.
Kitagawa, T., Kimura, S., Nakata, H., Yamada, H., Nitta, A., Sasai, Y. and Sasaki, H. (2009) Immature Pacific bluefin tuna, Thunnus orientalis , utilizes cold waters in the Subarctic Frontal Zone for trans-Pacific migration. Environmental Biology of Fishes, 84, 193-196
木村伸吾．(2009) 東京大学海洋アライアンスについて．日本水産学会誌，75，129-130
北川貴士．(2009) 照度センサ付きデータロガー．バイオロギング，日本バイオロギング研究会編，京都通信社，pp116．
北川貴士．(2009) クロマグロは水温変化に敏感だった．バイオロギング，日本バイオロギング研究会編，京都通信社，108–111．
北川貴士．(2009) 日本近海でのクロマグロの行動生態と水温適応．農林水産技術 研究ジャーナル32 (8)，10–14．
銭本慧・北川貴士・木村伸吾．(2009) ウナギ属魚類の卵稚仔輸送に関わる大西洋と太平洋の海洋環境の比較．日本海洋学会，東京，4月．
Miyake, Y., Kimura, S., Kawamura, T., Horii, T., Kurogi, H. and Kitagawa, T. (2009) Simulating dispersal processes of abalone larvae using a coupled particle-tracking and hydrodynamic model. 7th International Abalone Symposium, Pattaya, Thailand, July.
宮崎幸恵・金煕容・山田祥朗・北川貴士・木村伸吾．(2009) 安定同位体比によるウナギ親魚の生息域解明に関する研究．日本水産学会秋季大会，岩手，9月．
森岡裕詞・木村伸吾・笠井亮秀．(2009) 海峡域の干潟に生息する二枚貝の摂餌に対する底生微細藻類の役割．日本海洋学会秋季大会，京都，9月．
Miyazaki, S. (2009) Feeding ecology of leptocephali. The 12th Annual Meeting of East Asia Eel Resource Consortium (EASEC), Tokyo, Nov.
銭本慧・北川貴士・笹井義一・佐々木英治・木村伸吾．(2009) 大西洋と太平洋に生息するウナギ属魚類3種の卵稚仔輸送過程．水産海洋学会研究発表大会，長崎，11月．